Thập kỷ đầu tiên của thế kỷ 21 ghi nhận nhiều tiến bộ y học có tính chất đột phá và 125 chuyên gia trong nhiều lĩnh vực y tế trên khắp thế giới đã thống nhất chọn ra 5 tiến bộ y học có ảnh hưởng nhất thập kỷ.
Từ ngày 18-26/1/2016 ,Bệnh viện đa khoa Huyện Mộc Châu đã tổ chức lớp đào tạo Quản lý chất lượng bệnh viện cho 42 cán bộ là trưởng phó khoa, điều dưỡng trưởng , giảng viên là Phó giáo sư, Tiến sĩ Y học Vũ Khắc Lương công tác tại Viện y học dự phòng, trường đại học y Hà nội- một trong những phó giáo sư có nhiều kinh nghiệm giảng dạy về quản lý chất lượng bệnh viện trực tiếp giảng dạy. Đây là một nội dung nằm trong kế hoạch hoạt động của bệnh viện nhằm nâng cao chất lượng bệnh viện năm 2016 với những mục tiêu đặt ra với các học viên sau khi hoàn thành khóa học như sau:
Chiều ngày 20/10/2015, Hội đồng khoa học Bệnh viện đa khoa Mộc Châu đã tổ chức hội nghị nghiệm thu đề tài khoa học cấp cơ sở năm 2015.Tại hội nghị đã có 6 đề tài được thông qua, kết quả có 05 đề tài xếp loại khá, 01 đề tài đạt yêu cầu.
Chiều ngày 14/7/2015, Bệnh viện đa khoa Huyện Mộc Châu đã tổ chức tập huấn bệnh MERS – CoV cho toàn thể cán bộ thầy thuốc bệnh viện.
Kể từ 1/6/2015 nhờ từ nguồn vốn xã hội hoá, liên doanh, liên kết… Bệnh viện đa khoa Huyện Mộc Châu đã triển khai thêm nhiều dịch vụ kỹ thuật mới ứng dụng trong tầm soát, chẩn đoán sớm, điều trị các bệnh lý sau: